Anche se la sua architettura rimane la stessa dell'epoca in cui fu costruita, a cappella tombale fu aggiunta alla chiesa alla fine dell'invasione latina nel 13secolo.
Dopo la riconquista la chiesa fu mantenuta Cristiani e adibito a convento. Nel 1455 il patriarcato venne qui trasferito e continuò il suo servizio come patriarcato fino al 1586. Tra gli anni di 1574-1595, la chiesa fu trasformata in moschea da Sultano Murat III e gli fu dato il nome Fethiye. Dopo la fondazione della repubblica, una parte della moschea fu trasformata nel Museo Fethiye e il museo fu trasformato in un'unità del Museo di Santa Sofia dopo essere stato riparato nel 1938-1940.
Se sei un fan degli affreschi del XIV secolo, ti consigliamo vivamente di inserire una visita al Museo Fethiye e al Museo Chora nella tua lista di cose da fare mentre pianifichi il tuo viaggio a Istanbul.
