Si bien su arquitectura sigue siendo la misma de la época en que se construyó, un capilla de la tumba se añadió a la iglesia al final de la invasión latina en el 13siglo XX.
Tras la reconquista, la iglesia fue conservada por Cristianos y utilizado como convento. En 1455 se trasladó aquí el patriarcado y continuó su servicio como patriarcado hasta 1586. Entre los años de 1574–1595, la iglesia fue convertida en mezquita por Sultán Murat III y se le dio el nombre de Fethiye. Después de la fundación de la república, una parte de la mezquita se convirtió en el Museo Fethiye y el museo se convirtió en una unidad del Museo de Santa Sofía después de ser reparado en 1938–1940.
Si eres fanático de los frescos del siglo XIV, te recomendamos encarecidamente que incluyas una visita al Museo Fethiye y al Museo Chora en tu lista de tareas pendientes mientras planificas tu viaje a Estambul.
