يفتح مسجد خرقة شريف أبوابه للزوار من اليوم الخامس عشر من شهر رمضان وحتى ليلة القدر، وذلك خلال الفترة الفاصلة بين صلاتي الظهر والعصر. وخلال بناء المسجد، شُيِّدت العديد من المباني المجاورة كملحقات له، منها مدفنٌ لأكبر أفراد عائلة أويسي ، ومكتبٌ للنائب، وثكناتٌ للجنود (هذا المبنى يُستخدم حاليًا كمدرسة خرقة شريف الابتدائية)، وغرفٌ للمناوبين.
يمكن دخول ساحة المسجد عبر ثلاث بوابات مبنية من حجر الكفكي المنحوت. يضم المسجد مئذنتين، لكل منهما شرفة واحدة. وتغطي قبة ذات ثماني نوافذ المسجد ذو الأضلاع الثمانية. فوق البوابة على الجانب الأيمن من الساحة، يوجد نقش خطي من تصميم كازاسكر مصطفى عز الدين ، تحت توقيع السلطان عبد المجيد . أسفل القبة، يمكن رؤية ثمانية نقوش شعرية مؤطرة من تصميم الخطاط نفسه. كما تُعرض ثمانية نقوش مؤطرة فوق المنبر، وهي من أعمال عبد المجيد نفسه وتحمل توقيعه. منبر الوعظ والمحراب والمنبر مصنوعة من البورفيري الأحمر.
