يقع جامع بايزيد في قلب المجمع. يبلغ قطر قبته الرئيسية 16.78 مترًا، وترتكز على أربعة أعمدة. وتُعدّ أعمال البناء الحجرية والخشبية والزجاج الملون فيه تحفًا فنية رائعة. أما مواد رصف الفناء والأعمدة المستخدمة كحوض للوضوء، فقد أُعيد استخدامها من آثار بيزنطية. وتُظهر هذه الأعمدة تحديدًا براعة الصنعة البيزنطية.
يقع مطبخ الحساء وخان العربات على يسار المسجد، ويستخدمان اليوم من قبل مكتبة بايزيد الحكومية . أما المؤسسة التركية للخط العربي فتستخدم المدرسة الدينية الواقعة في أقصى يمين المسجد كمتحف. ويقع الحمام بعيدًا عن المدرسة الدينية، في شارع أوردو بجوار قسم الآداب.
تم العثور على المقابر على جانب القبلة [ مكة ] من المسجد. تم دفن السلطان بايزيد الثاني وابنته سلجوق خاتون ومهندس التنظيمات فرماني مصطفى رشيت باشا هنا.
الكلمات لا تكفي لوصف هذا المسجد الجميل، لماذا لا تخطط لرحلة إلى اسطنبول مع أفضل عروض الإقامة؟