Yıldırım Bayezid a preluat controlul asupra zonei de tranziție din Bosfor prin construirea Anadoluhisarı. Pe de altă parte, în timpul pregătirilor pentru cucerirea Istanbulului, Sultanul Fatih Mehmet a consolidat mai întâi Anadolu Hisarı prin înconjurarea acesteia cu ziduri. După aceasta, a dorit să preia controlul deplin asupra zonei de tranziție din Bosfor prin construirea unei a doua fortărețe în fața acesteia, motiv pentru care a fost construită Rumeli Hisarı.
Conform documentelor, la Fortăreață, al cărei plan inițial a fost întocmit de Fatih Sultan Mehmed, 1000 de meșteri și peste 2000 de muncitori au lucrat zi și noapte în timpul construcției fortăreței, iar aceasta a fost finalizată în 4 luni. Cele trei turnuri de pe metereze au fost construite de vizirii lui Fatih, Halil Pașa, Zağanos Pașa și Saruca Pașa.
Odată cu cucerirea Istanbulului, funcția atât a lui Anadolu Hisarı, cât și a lui Rumeli Hisarı a luat sfârșit. Se știe că, după cucerirea Istanbulului, la 29 mai 1453, acesta a fost folosit ca loc unde erau pedepsiți ienicerii criminali și unde erau reținuți membrii consulatului care luptau cu statul.
Fortăreața a fost reparată în 1918 , complet revizuită în 1953 , iar zona unde se află minaretul unei foste moschei a fost transformată într-un teatru în aer liber. Atrăgând imediat atenția printre arhitecturile Bosforului, Rumeli Hisarı găzduiește în prezent concerte, teatre și o diversitate de activități culturale și artistice.