Grazie al loro atteggiamento incoraggiante durante la guerra, alla comunità ebraica fu concesso il diritto di avere una propria sinagoga e il loro rabbino fu trattato con benevolenza. Un luogo di culto fu assegnato alla comunità turco-ebraica di Karayim, dove ora sorge la moschea di Arpacılar .
Come primo compito, il sultano Maometto il Conquistatore iniziò a far restaurare molti luoghi distrutti durante la guerra. La prima seria attività di restauro fu la ricostruzione delle mura distrutte durante la conquista. Il sultano Maometto il Conquistatore acquistò Santa Sofia, che si trovava in uno stato di degrado e abbandono, e la fece restaurare. In seguito la trasformò in una moschea.
Mentre da un lato Istanbul veniva ricostruita, dall'altro si creavano nuove aree residenziali per riorganizzare la città. Le case non occupate venivano assegnate a coloro che avevano prestato servizio durante la guerra, così come a chiunque desiderasse trasferirvisi. La popolazione musulmana proveniente dall'Anatolia e dalla Rumelia fu incoraggiata a migrare verso la città. Quando questo piano non andò a buon fine, furono inviati firmani del Sultano nelle varie città e fu annunciato che un certo numero di persone di ogni ceto sociale sarebbero state esiliate a Istanbul. Cristiani ed ebrei provenienti da diverse regioni furono fatti arrivare e ricevettero alloggi in specifiche zone della città.
Alla fine del 1457 , nuovi immigrati giunsero in città a causa del grande incendio che distrusse l'antica capitale di Edirne . Nel 1459 , Istanbul fu divisa in quattro regioni amministrative, ognuna con caratteristiche demografiche diverse, e cinquant'anni dopo la conquista divenne la più grande città d' Europa .
Istanbul, che era diventata una città straordinaria all'inizio del XVI secolo, subì gravi danni a causa del terremoto del 14 settembre 1509 , noto anche come il "Piccolo Giorno del Giudizio" . Il sisma, durato 45 giorni, rase al suolo migliaia di edifici. Nel 1510 , Istanbul fu quasi completamente ricostruita dal sultano Bayezid II , che diede lavoro a 80.000 persone.
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