Esta mezquita, que está situada en Plaza Bayezid, fue construido por Sultán Bayezid II y completado en los años 1500–1505. Originalmente se pensó que había sido diseñado por Arquitecto Sinan Hayreddin or Arquitecto Kemaleddin pero investigaciones posteriores sugieren que el arquitecto pudo haber sido Yakubşah Bin Sultan. El complejo está compuesto por una mezquita, una cocina, una escuela primaria, un hospital, un medresse, un hamam, un comedor de beneficencia para los pobres y un caravanserai. Se diferencia del centro de la Fe anterior, por el hecho de que no fue construido simétricamente, sino en un estilo aparentemente aleatorio.

Mezquita de Bayezid Está en el centro del complejo. Su cúpula principal es 16.78 metros de diámetro y está sostenido por cuatro pilares. La artesanía en piedra y madera y las vidrieras son obras maestras artísticas. Los materiales de pavimentación del patio y los pilares utilizados como depósito para las abluciones se recuperaron de las ruinas bizantinas. Estos pilares en particular demuestran la calidad de la mano de obra bizantina.

El comedor social y el Caravanserai están a la izquierda de la mezquita y son utilizados hoy por el Biblioteca Estatal de Bayezid. La Fundación Turca de Caligrafía utiliza el medresse a la derecha de la mezquita como museo. El hamam está lejos del medresse, en la calle Ordu al lado del Departamento de Literatura.

Las tumbas se encuentran en el Kibla [la meca] lado de la mezquita. Sultán Bayezid II, su hija Selcuk Hatun y arquitecto de Tanzimat Fermanı, Mustafa Resit Pasa, están enterrados aquí.

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